更先进!能看清体内基因表达的显微镜今问世(图)

最近一期的《科学》杂志报道:美国加州理工学院的一支团队开发出了一套全新的超声成像系统,它能够在活体动物中,让科学家们亲眼看到基因的表达。尽管这项技术目前还较为初步,但可以想象,一旦发展成熟,它将能给多种疾病的检测带来突破。

事实上,过去的科学家们早已开发出了许多检测基因表达的方法。其中最为知名的,或许就是绿色荧光蛋白(GFP)系统了。这种系统能够在显微镜下,让我们看清组织中哪些细胞有着特定的基因表达,甚至能让我们在一个个细胞里看清相应蛋白的位置。为此,开发出这套系统的科学家们也在2008年分享了诺贝尔化学奖的殊荣。

但GFP系统有一个很大的局限,那就是“光”。在培养皿中,光可以透过薄薄的几层细胞,激发出绿色荧光。但如果要把这套系统搬运到大型活体动物体内,就很容易行不通——它们的器官和组织太厚了,光穿透不进去。

▲因为发现并开发了GFP系统,三名科学家斩获了2008年的诺贝尔化学奖。左起:时任美国麻省伍兹霍尔海洋生物实验所教授的日裔科学家下村脩,美国科学家马丁·沙尔菲,加州大学圣地亚哥分校生物化学及化学系教授、华裔科学家钱永健。(图片来源:诺奖官网截图)

那么有什么方法能够在大型活体动物中实时观察基因表达吗?研究人员们的选择是“超声成像”。说到超声成像,大家都不会陌生。在检查心脏的缺陷,或是检查胎儿的发育时,医生们都会用到这种非常成熟的技术。它的好处就是能穿透厚厚的器官和组织。

下一个研究,就是怎么用超声波看到特定的细胞了。研究人员从一些水生微生物中得到了灵感:这些微生物会在体内形成一类特殊的蛋白结构,它们就像是气球一样,中间充满了空气。对水生微生物而言,这种蛋白结构能给它们提供浮力。而在科学家的眼中,由于结构中的空气与细胞中的水分在性质上具有天壤之别,这种蛋白结构足以提供超声成像所需的分辨率。

然后还有一个技术难题需要解决——怎么把这些中空的蛋白结构弄到哺乳动物细胞里去。这可不是一个简单的问题。表达这些蛋白结构的微生物都属于原核生物,而哺乳动物属于真核生物,两者的基因调控方式非常不一样。而且,这种蛋白结构需要很多条不同基因的参与,把这些基因同时挪到哺乳动物细胞里,同样不简单。

在合成生物学技术的帮助下,研究人员们终于把所需的多条基因转入了哺乳动物细胞系,并让它们稳定表达。

功夫不负有心人。经过检验,这些细胞也终于能够形成类似的中空蛋白结构。

▲合成生物学的突破,终于让哺乳动物细胞也能合成这种中空的蛋白结构(图片来源:参考资料[1])

接下来就是检验这些结构能否真的协助超声成像。研究人员开始做实验进行组别对照:在一部分癌细胞中,他们引入了这种中空蛋白结构;在另一部分癌细胞中,他们使用的还是传统的荧光蛋白。随后,这些癌细胞被分别注射到小鼠的左右两侧,诱导生成肿瘤。

在几天的诱导表达后,研究人员们清楚地看到了两种系统之间的区别。限于组织的穿透性,在“荧光蛋白”组,我们只能看到“一坨”荧光,看不清太多细节。而在“中空蛋白结构”组,超声成像清楚地看到,只有肿瘤最外面一层有着报导基因(reporter gene)的表达。后续的组织学检测,也证实了超声成像的准确性。

▲只有肿瘤最外面一层才有报导基因的表达(图片来源:参考资料[1])

可以想象,如果这套系统能得到后续的应用与开发,人们就能对活体动物里的基因表达进行更好的研究与探索。这也正是为何许多科学家们对其表示出浓厚兴趣的原因。“它能带来观察基因调控的全新方式”,一名没有参与本研究的科学家说到。

有科学家指出,这套系统对基因编辑能力有着很高的要求。想让它得到更广泛的应用,还需要进一步降低使用的门槛。

药明康德团队报道,在此表示诚挚感谢!

参考资料:
[1] Arash Farhadi et al., (2019), Ultrasound imaging of gene expression in mammalian cells, Science, DOI: 10.1126/science.aax4804
[2] Ultrasound can ‘see’ when tumor cells turn genes on and off, Retrieved September 26, 2019, from https://www.sciencemag.org/news/2019/09/ultrasound-can-see-when-tumor-cells-turn-genes-and