包括加州大学洛杉矶分校菲尔丁公共卫生学院等多个高校研究人员组成的一个研究小组发现,变异病毒增长的规模对目前的疫苗和疗法构成潜在的挑战和威胁。
该项研究成果日前已发表在分子医学杂志【EMBO Molecular Medicine】六月份期刊上。其指出COVID-19病毒株的变异速度清楚地表明,快速进化的新病毒株可能产生抗效和变异,从而限制疫苗、治疗和诊断试验的效力。
加州大学洛杉矶分校菲尔丁分校公共卫生学院生物统计学教授、该项研究的联合首席作者Christina Ramirez博士说:“虽然2020年4月全世界只有大约10种主要的病毒突变,但到2021年春,它们的数量已经上升到大约100种。”,研究人员检测了2020年1月至2021年3月分离的COVID-19序列的突变。
拉米雷斯说:“在整个2020年到2021年第一季度,发现了更多的基因突变,并迅速传播,尽管采取了封锁和其他措施来遏制这种传播。”病毒传播的速度,即使在封锁期间,也强调了抑制高传染性呼吸道病毒传播的困难。”
研究小组由加州大学洛杉矶分校的科学家组成;加大戴维斯分校;Friedrich-Alexander大学(FAU)和德国科隆大学研究了在美国、印度、巴西、俄罗斯、英国、法国、西班牙、德国、南非和中国分离的变异和变异。研究小组将变异定义为具有一组特定突变的病毒,按照这个标准,截至2020年4月,只有大约10种突变是普遍存在的,但截至2021年1月,至少发现了77种——可能多达100种新的突变。
“今年4月底,我们跟踪了印度爆发的COVID-19感染,每天有超过353000例病例和2812例死亡,这是有史以来全球最高的病例数,”FAU的合著者Stefanie Weber博士说目前已知的病毒变种可能比武汉的原始病毒更具传染性,也可能导致更多的疾病。”
正如分析中引用的一个例子(发表为“COVID-19全球复制推动病毒基因组突变的快速上升和选择:一项时间过程研究——疫苗和治疗的潜在挑战”),所谓的英国变体,也称为B.1.1.7或VOC202012/01,现称为α,它于2020年9月在英国首次被发现。12月,它被报道为一种快速传播的变种,共有14个突变。这种变异与较高的遗传率和至少一例确诊的再感染病例有关。
他们称在被封锁的2020年12月23日,该变种在三个国家被发现。而截至今年4月5日,在108个地方发现变种。
“这如果继续下去,尽管有疫苗,而我们不可能迅速阻止传播的话,那就可能会进一步发展,” FAU 大学 Erlangen-Nürnberg 病毒研究所和科隆大学遗传学研究所的Walter Doerfler博士说。然而,某些冠状病毒突变体的感染是否与COVID-19疾病的类型和严重程度有关尚不清楚。我们关注的另一个方面是发现,在调查的10个国家中,40%到70%的新Covid-19病毒突变是胞苷(C)到尿苷(U)的转变。显然,这种病毒基因组中C残基的缺失似乎被大约20%的鸟苷(G)或C突变为腺苷(A)或U残基所抵消。我们仍然对Covid-19病毒突变体的突变和选择的复杂相互作用感到困惑。”
考虑到COVID-19的未知程度,以及进一步突变和变异的风险,作者说公共卫生机构必须投入资源进行深入和持续的研究;尤其重要的是追踪整个Covid-19病毒病毒基因组的潜在突变,包括复制功能、所有病毒的各种蛋白质和病毒基因组。
“我们的工作记录了Covid-19病毒突变体选择的速度和威力,这反过来可能会降低COVID疗法和疫苗的疗效,”合著者、加州大学戴维斯分校传染病专家Barbara Weiser博士说为了优化Covid-19病毒的治疗和预防,必须继续对Covid-19进行分子测序以检测新的突变体和变异体。”
加州大学戴维斯分校的Harold Burger博士也是该文章的合著者,他补充说:“在理想情况下,分子测序除了从病情较重的病人身上获得的样本外,还应包括来自年龄不同的无症状和轻度病患的病毒。无症状的个体可以而且确实会将病毒传染给他人。疾病的程度是病人状况的结果,而不仅仅是病毒的作用。这种方法将提供有关该流行病演变和传播的宝贵信息。”
研究人员从GISAID下载的已知采样日期的Covid-19病毒全基因组序列进行了分析。在选定的时间段内,包括每个国家的所有完整序列和采样日期。根据采样日期对序列进行了分类。
来源:
https://ph.ucla.edu/news/press-release/2021/jun/sars-cov-2-worldwide-replication-drives-rapid-rise-and-selection
(美国华文网 圣地亚哥华文网编发 USChinesePress.com SanDiegoChinesePress.com)